Handlung
Zwei Jahre später im Jahre CE 73 werden, während des Besuchs von Cagalli Yuula Attha, der neuen Präsidentin von Orb, auf einer Weltraumkolonie die drei Prototypen ZGMF-X24S Chaos Gundam, ZGMF-X31S Abyss Gundam und ZGMF-X88S Gaia Gundam der neuen Second Generation Gundam Mobile Suits gestohlen. Bei den Dieben handelt es sich um die drei Extended Stellar Loussier, Sting Oakley sowie Auel Neider.
Shinn Asuka, der nach dem Tod seiner Familie nach PLANT gegangen ist, war in die Armee von ZAFT eingetreten und auf der fraglichen Weltraumstation an Bord des neuen Kampfschiffes Minerva stationiert. Mithilfe seines ZGMF-X56S Impulse Gundams, der ebenfalls ein Prototyp ist, bewahrt er Cagalli und ihren Bodyguard Alex Denon (alias Athrun Zala), die sich in einen ZAKU geflüchtet hatten, davor von den drei Gundams getötet zu werden. Den Dieben gelang jedoch die Flucht, so dass die Minerva beauftragt wurde die drei Gundams zurückzubringen.
Während ihrer Suche geschieht es jedoch, dass einige Veteranen von Junius 7 die Überbleibsel von Junius 7, welche im Weltall auf einer festen Bahn kreisten, ablenkt so dass sie drohen auf die Erde zu stürzen. PLANT und die Erdallianz wollen dies verhindern und PLANT entsendet Truppen, um Junius 7 in zwei Teile zu brechen, welche dann haarscharf an der Erde vorbeifliegen sollen. Unter den Truppen ist auch die Crew der Minerva, welche zusammen mit dem enttarnten Athrun Zala versuchen die Welt zu retten. Die ursprüngliche Operation misslingt aber, da niemand wusste, dass die Urheber dieser Katastrophe immer noch auf Junius 7 waren und versuchten den Plan zu vereiteln. Der resultierende Kampf verzögerte die Operation so lange, dass es nun zu spät war den ursprünglichen Plan umzusetzen.
Da sie keine Zeit mehr hatten, entschloss sich die Kapitänin der Minerva Gladia Thalis mit den Trümmern von Junius 7 in die Erdathmosphäre einzutreten und sie von dort aus mit dem Tannhäuser, der riesigen Protonenkanone der Minerva, zu zerstören. Im letzten Moment gelingt es ihr die Trümmer zu sprengen, jedoch zerspringt der riesige Trümmerhaufen in tausende von kleineren Brocken, welche wie ein Meteoritenschauer auf die Erde niedergehen und viele Opfer fordern.
Die Erdallianz macht daraufhin PLANT für die Zerstörung großer Teile der Erde verantwortlich und erklärt ihr den Krieg mit großer Unterstützung der Bevölkerung, welche PLANT ebenfalls verantwortlich macht und die Vernichtung der Weltraumkolonien und aller Koordinatoren fordert. Die Minerva, die sich nun auf der Erde befand, fand Unterschlupf in Orb, wo sie repariert werden konnte. Shinn begegnet während seines Landgangs Stella und rettet sie vor dem Ertrinken, nachdem sie von einer Klippe gefallen war, unwissend dass es sich um einen der Diebe handelte. Um sie zu beruhigen verspricht er sie zu beschützen und das hysterische Mädchen beruhigt sich. Später wird Stella von Auel und Sting abgeholt und Shinn geht zurück zur Minerva.
Durch ein Komplott in der Regierung, welches Orb gegen den Willen von Cagalli zu einem Bündnispartner der Erdallianz macht, wird sie gezwungen die Gewässer von Orb zu verlassen. Kaum war sie außerhalb des Einzugsgebiets von Orb, wurde sie von einer riesigen Flotte der Erdallianz erwartet, welche sie angreift mit dem Ziel die zahlenmäßig unterlegene Minerva zu versenken.
Erstmals verwendete die Erdallianz in diesem Kampf einen neuen krebsartigen Mobile Armor der mit einem Positronenschild ausgerüstet ist, welcher Schüsse von Positronenkanonen blockt, so dass nicht einmal der Tannhäuser ihm zu Leibe rücken kann. Shinns Gundam ist dem Mobile Armor unterlegen und wird schwer beschädigt. Als er jedoch am verlieren ist, erinnert er sich an seine Familie und beschließt nicht dort und auf diese Weise zu sterben. Unwillkürlich entdeckt er seinen SEED und besiegt auf eindrückliche Weise den Mobile Armor und einen großen Teil der Flotte der Erdallianz, worauf sich die restlichen Schiffe zurückziehen.
Im weiteren Verlauf der Serie kommt es immer wieder zu Begegnungen mit der EA (Earth Alliance) und der Minerva, die versucht der Übermacht der EA und neuerdings auch ORB, das neu zur EA beigetreten ist,zu entkommen. In diesen Konflikt mischt sich auch die Crew Archangel, nachdem sie Cagalli vor einer politischen Zwangshochzeit bewahrt hatten, ein. Ohne Partei zu ergreifen, versuchen sie mit Hilfe Kira Yamatos und seines ZGMF-X10A Freedom die Kämpfe zu beenden. Bei ihrem ersten Eingreifen führt dies jedoch zum Tod des FAITH-Mitgliedes und neuen Piloten der Minerva, Heine Westenfluss (Gesprochen von T.M. Revolution), dessen GOUF durch Freedom beschädigt wurde und dann von Stella Louisser und ihrem Gaia zerstört wurde. Sein Tod stärkt den mittlerweile zu einem FAITH-Mitglied und Piloten gemachten Athrun, der wieder in die Armee eingetreten war, in seinem Entschluss ZAFT und der Minerva zu helfen. Ihm zur Verfügung gestellt wurde der ZGMF-X23S Savior, ebenfalls ein neuer Gundam, vom PLANT-Vorsitzenden Gilbert Dullindal.
Es vergeht einige Zeit und die Minerva wird beauftragt ein ehemaliges Laboratiorium der EA näher zu untersuchen und findet dort Aufzeichnungen über Experiment mit biologischen CPUs, sog. Extended. Shinns Hass auf die EA und Blue Cosmos wird dadurch nur noch weiter genährt. Während das Laboratorium noch weiter erforscht wird, ist Stellar in ihrem Gaia dorthin unterwegs.
Athrun und Shinn fangen sie ab und überwältigen ihren Mobile Suit. Da entdeckt Shinn, dass es sich beim Piloten um Stellar handelt. Sie wird auf die Krankenstation der Minerva gebracht,wo sie medizinische Hilfe erhält,aber auch festgehalten wird,da sie ein Extended und somit ein interessantes Forschungsobjekt abgibt.
Nach dieser Episode kommt es erneut zu einem Gefecht zwischen der Minerva und den Seestreitmächten der EA, das widerrum durch die Archangel gestört wird. Im Kampf wird Abyss zerstört sowie sein Pilot Auel durch Shinn getötet. Er zerstört auch beinahe die gesammte Flotte der EA und alle Schiffe ORBs, die am Kampf teilnahmen. Athruns Mobile Suit wird durch Kira so schwer beschädigt, dass eine Reparatur nicht mehr möglich ist.
Später erfährt unser Held , dass Stella nur noch wenige Tage zu leben hat, da ihr Körper eine gewisse Droge braucht ohne die er nicht mehr funktionieren kann. Eine Folge der Therapie,die sie als Extended durchmachen musste.
Mit Hilfe seines Freunds und Piloten, Rey za Burrel, befreit er die geschwächte Stella und bringt sie zur EA zurück.
Der Vorgesetzte von Stella, Neo Lorrnoke, trifft sich mit Shinn und verspricht ihm Stellar aus dem Militärdienst zu entlassen, weil er sich für sie ein glückliches Leben,weit entfernt von allen Kämpfen, wünscht. Nach seiner Rückkehr zur Minerva wird er überrschenderweise vom Vorsitzenden Dullindal höchstpersönlich begnadigt und muss keine Disziplinarverfahren befürchten.
Entgegen seiner Erwartungen begegnet er Stellar aber wieder im Kampf um Berlin, wo ein riesiger und unglaublich zerstörerischer Mobile Suit der Destroy die Stadt dem Erdboden plattmacht und die Streitkräfte ZAFTs ohne große Mühe vernichtend schlägt. Tragischerweise ist Stellar diejenige, die ihn steuert und als Shinn sich aufmacht den Koloss, der unzählige Menschenleben auf dem Gewissen hat, zu zerstören, muss er feststellen, dass Stellar der Pilot ist, nachdem er das Cockpit direkt angegriffen hatte und sie beinahe getötet hätte.
Er zögert sie attackieren und versucht sie wieder zur Besinnung zu kriegen, was ihm auch gelingt. Als aber Kira in seinem Freedom, der schon seit längerer Zeit versucht hatte Destroy aufzuhalten, nachsehen will, was vor sich geht, erblickt ihn Stellar und erschreckt sich furchtbar. Weil Neo sie vor ihm gewarnt hatte und er Neo in seinem Windam angeschossen hatte, steht sie nun Todesängste durch und ihre labile Psyche bringt sie dazu ihn anzugreifen. Sie vergisst Shinn, der ihm Weg steht und zielt auf Freedom. Dieser ist schneller und beschädigt den Destroy so schwer, dass dieser unter einer großen Explosion niedergeht.
Shinn zieht das sterbende Mädchen aus ihrem Cockpit und mit ihrem letzten Atemzug sagt sie ihm, dass sie ihn liebt. Dadurch, dass er wieder einen geliebten Menschen verloren hat, ist er schwer getroffen, hat er doch immer noch nicht den Tod seiner Eltern und vor allem seiner kleinen Schwester Mayu verkraftet. Er schwört Rache an Stellars Mörder und trainiert wie ein besessener daraufhin Freedom im Zweikampf zu besiegen. Rey hilft ihm dabei und zusammen studieren sie die Aufnahmen von allen Kämpfen in die Freedom verwickelt war.
In Skandinavien ist es schließlich so weit. Die Archangel, welche nun offiziell zu einem feindlichen Schiff erklärt worden war, wurde von ZAFT-Truppen eingekesselt und versucht sich mit Hilfe von Kira aus dieser misslichen Lage zu befreien. Kira wird mitten im Kampf vom Impulse angegriffen und nachdem er versucht hatte ihm die ganze Zeit zu entkommen und sein Schiff zu verteidigen, beschließt er sich Shinn zu stellen.
Hierbei nutzt Shinn gezielt die Schwäche Kiras aus niemals auf das Cockpit eines feindlichen Mobile Suits zu zielen, sondern primär die Hauptkamera im Kopf oder die Arme abzuschneiden und seinen Gegner so kampfunfähig zu machen. Ohne Rücksicht auf Verluste greift er den rein technisch überlegerenen Freedom immer wieder an und setzt alles daran ihn zu beschädigen und zu zerstören. Hierbei hilft ihm vor allem die Tatsache, dass der Impulse modular aufgebaut war, also Oberkörper, Beine und Backpacks ausgetauscht werden konnten, so lange das Cockpit in Form des Core Splendors nicht beschädigt war.
Es gelingt Shinn schlussendlich Freedom zu vernichten, indem er ihm eines seiner Anti-Schiff Schwerter durch den Unterkörper rammt. Athrun, der das Spektakel mitangesehen hatte, sah wie sein Freund Kira vermeintlich getötet wurde und er begann an seinem Weg zu zweifeln.
Quelle: Wikipedia